Tiocianāta un cilvēka ogļskābes anhidrāzes II mijiedarbības kvantu ķīmisks pētījums
2013
Mendel Fleisher, Raivis Zalubovskis, Andulis Šmidlers, Daina Jansone

Lai noskaidrotu tiocianāta un CA II mijiedarbības mehānismu, veikta detalizēta kvantu ķīmiskā izpēte, izmantojot pusempīrisko PM6 metodi. Aktīvā centra modelis tika balstīts uz CA II struktūras kristalogrāfiskajiem datiem (PBP kods - 2CBA). Modelī tika iekļauti: Zn2+ katjons,kas ir saistīts ar OH- ligandu un triju histidīnu – His94, His96, His119 – atlikumu imidazolu gredzeniem; atlikumi Glu106, Thr199, Thr200, His107, Arg246, Asn244, Gln92 un 8 ūdens molekulas. Mijiedarbības pirmā stadija noris spontāni un tās gaitā notiek tiocianāta molekulas deprotonēšana un tiocianāta anjona (SCN-) veidošanās. Pēc ts pārvarēšanas cinka koordinācijas sferā noris ūdens molekulas aizvietošana ar tiocianāta anjonu SCN-. Līdzsvara stāvoklī saites Zn-N garums ir 1,844 Å, un atbilstošā saites kārta ir 0,639.


Atslēgas vārdi
carbonic anhydrase II, thiocyanate, inhibitor, PMH method

Fleisher, M., Zalubovskis, R., Šmidlers, A., Jansone, D. Tiocianāta un cilvēka ogļskābes anhidrāzes II mijiedarbības kvantu ķīmisks pētījums. Materiālzinātne un lietišķā ķīmija . Nr.27, 2013, 22.-26.lpp. ISSN 14077353.

Publikācijas valoda
Latvian (lv)
RTU Zinātniskā bibliotēka.
E-pasts: uzzinas@rtu.lv; Tālr: +371 28399196